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Notas sobre o artigo - Statistical Confidence Corridors for the analysis of brain imaging data.
2020-06-25
Por enquanto, o que quero fazer com este post é retirar do artigo certas secções e subsecções nas quais só tenho apontamentos e ideias anotados para antes de terminar o artigo. Há bastantes coisas que tenho de aperfeiçoar nos SCCs (para lhes chamar alguma coisa rapidamente) e aqui vou fazer uma enumeração de cenas das quais não me devo esquecer antes da publicação:
1-Limitações e investigação futura
Encontrei uma série de artigos interessantes que apontam para novas vias de investigação e também para o contrário: o que parecem ser pontos intransponíveis que terão de ser contornados. Algumas destas referências deveriam ser comentadas nesta secção, ainda que apenas para contextualizar o que foi feito até à data e também para compreender como a metodologia SCC se enquadra na investigação presente e futura e a sua potencial repercussão.
Entre estas limitações e propostas para investigação futura encontram-se:
O PET carece de medidas padrão e não tem um limiar consensual para o diagnóstico
Dada a ligação entre o metabolismo da glicose e as mitocôndrias, e o facto de o ADN mitocondrial ser herdado por via materna nos seres humanos, argumenta-se aqui que uma bioenergética alterada pode ser um acontecimento a montante naqueles com antecedentes maternos de DA de início tardio ligação
Preocupações sobre as padronizações estabelecidas
Custos: em agosto de 2008, o Cancer Care Ontario informa que o custo incremental médio atual para realizar um exame PET na província é de 1,000{1,200$ por exame. Isto inclui o custo do radiofármaco e um honorário para o médico que lê o exame.[75 Wiki].
Existem novas vias promissoras para o diagnóstico precoce da DA através de outros métodos de diagnóstico, como análises ao sangue que detetam níveis de proteínas Tau fosforiladas. Thijssen EH et al. “Diagnostic value of plasma phosphorylated tau181 in Alzheimer’s disease and frontotemporal lobar degeneration”. Nature Medicine.
Também novos tratamentos como: a ativação da PI3K impede a perda de sinapses induzida por AB42 e favorece a formação de depósitos de amiloide insolúvel.
2-Notas para o aperfeiçoamento do artigo:
- Adicionar referências cruzadas entre secções.
- Anexar o código das diferentes secções ou, pelo menos, fazer referência às diferentes pastas no GitHub.
- Incluir o grupo MCI nas nossas comparações (?).
- Deveria citar também os pacotes de nifti.
- Criar uma paleta de cores que seja a utilizada em Biomedicina em geral.
- Adicionar a autocitação como um feedback positivo autossustentado em MDD re/AD
- Manter uma voz ativa e usar o presente
- Remover os excessivos ”it is”, ”the’s”, ”that’s”.
- Colocar os adjetivos antes dos substantivos
- As regiões-alvo incluem a amígdala. Investigação futura.
- Área 20 de Brodmann == córtex temporal? As regiões destacadas na figura 1 são suficientemente precisas?
- Completar o repositório GitHub
- Cuidado com a citação do repositório GitHub; não encontrei um padrão.
- Adicionar detalhes sobre os dados PET (especificações) e o seu processamento (por exemplo, o mean average scaling e outros parâmetros utilizados no pré-processamento)
3-Tabela comparativa:
Agora o que se segue é fazer uma tabela comparativa com os turquoise plots de todas as comparações que tenho. A questão é como representá-la visualmente de uma forma atraente e sucinta. No artigo de Wang et al. (2019), o que fazem é dividir a imagem em 3 colunas e 5 linhas. As 3 colunas existem porque, ao utilizarem MCI, têm três comparações a fazer: ADvsCN, ADvsMCI, CNvsMCI. Mas no meu caso só temos AD e CN, pelo que por aí não faz sentido. Depois, as 5 linhas servem para ter 1 de grupo inteiro e 4 de subconjunto: ‘female’, ‘male’, <75, >75.
O que realmente tenho para mostrar numa imagem neste momento seria:
AD vs CN:
- para o grupo completo
- para mulheres
- para homens
- para menos de 75
- para mais de 75
Neste momento, o que me questiono é qual é a forma ideal de apresentar os resultados graficamente, o que realmente é algo que me preocupa bastante, pois acredito que boa parte do poder do estudo reside na forma de visualizar o tema. Acho que em duplicado (em dois Z estratégicos) a coisa ganharia bastante, e ganharia ainda mais se também utilizasse os MCI.
Por enquanto, o que vou fazer hoje é expor as mudanças segundo o sexo e segundo a idade.